Con D.G.R. 30/05/2003 n.13176 è stata approvata una Convenzione tra Regione Lombardia e ARPA Lombardia per l'affidamento a quest'ultima della gestione, del consolidamento e dell'ulteriore sviluppo dell'inventario delle emissioni all'anno 2001 attraverso l'approfondimento della stima delle emissioni di PM10 e l'inventario delle emissioni di PM2.5, il completamento dell'inventario emissioni di gas serra e la sua armonizzazione con le metodologie IPCC, lo sviluppo del database INEMAR ai fini della direttiva 96/61/CE (I.P.P.C.).
Con D.G.R. 22 dicembre 2005, n. VIII/1548 la Regione Lombardia ha rinnovato l'incarico ad A.R.P.A. per il triennio 2006 - 2008, approvando il Piano attività 2007 ed il relativo finanziamento con D.G.R. 2 agosto 2007, n. VIII/5292.